Do oddzielnego typu zakażeń wirusowych należą zakażenia szpitalne – do zakażenia dochodzi podczas pobytu w szpitalu czy przychodni. Są to np. zakażenia wirusem zapalenia wątroby, HIV czy gruźlicą.
Leczenie często opiera się na wykorzystaniu leków przeciwwirusowych lub na wsparciu odporności, aby organizm sam zwalczył infekcję. Głównym leczeniem jest leczenie objawowe.
Celem zdiagnozowania chorób można wykonać badania przeciwciał jak np. w panelu wirusowym. Można też wykonać badania typu PCR (wykrywanie RNA lub DNA wirusa) lub badanie typu Elispot.