Immunologia śluzówkowa to badanie odpowiedzi immunologicznych zachodzących na powierzchniach śluzówki, takich jak jelita, układ moczowo-płciowy i płuca. Błony śluzowe ludzkiego organizmu stanowią miejsce kontaktu ze środowiskiem zewnętrznym, dlatego też są szczególnie narażone na wpływ negatywnych czynników zewnętrznych, w tym drobnoustrojów chorobotwórczych, toksyn, alergenów. Ich ciągłość i prawidłowa funkcja zapewniają pierwszą barierę odporności, chroniącą wrażliwe środowisko wewnętrzne przed patogenami otoczenia.
Bariery te, które są pierwszą linią obrony przed patogenami zewnętrznymi, są tworzone przez komórki nabłonkowe, wydzielane przez nie substancje oraz połączenia międzykomórkowe, tutaj szczególnie tzw. połączenia ścisłe.

Do substancji chemicznych, produkowanych przez nasz organizm, regulujących odporność związaną z błonami śluzowymi należą:

  • lizozym,
  • laktoferyna,
  • śluz,
  • defensyny,
  • sIgA,
  • enzymy trawienne,
  • fizjologiczna flora bakteryjna,
  • odpowiedź komórkowa,
  • złożony system limfatyczny (MALT,GALT), (BALT), (NALT),