GHABS nigdy nie wiąże się z S. thermophilus. Zarówno PANDAS jak i ASD są związane wyłącznie z GABHS. Inne gatunki Streptococcus, w tym S. thermophilus, nie były nigdy zaangażowane w etiologię z tych zaburzeń. Wręcz przeciwnie, badania pokazują, że S. thermophilus wraz z innymi organizmami probiotycznymi może w rzeczywistości poprawić odporność przeciwko patogenom, takim jak GABHS. W jednym z badań z wykorzystaniem mleka hodowlanego z S. thermophilus i innymi bakteriami kwasu mlekowego spowodowało zmniejszenie lub całkowite wyeliminowanie GABHS i S.pneumoniae w jamach nosowych uczestników badań.

PANDAS jest zaburzeniem neurobehawioralnym charakteryzującym się wystąpieniem u dzieci zaburzenia obsesyjno-kompulsyjnego i/lub tików po zakażeniu paciorkowcem beta-hemolizującym grupy ropnej A (GABHS). Odkrycie przeciwciał przeciwko paciorkowcom zdolnych do reakcji krzyżowej z tkanką nerwową u niektórych osób z zaburzeniami ze spektrum autyzmu wzbudziło obawy, że S. thermophilus może również wyzwalać wytwarzanie przeciwciał przeciwneuronowych. Ta obawa jest nieuzasadniona, ponieważ pojawienie się PANDAS lub obecność przeciwciał przeciwko paciorkowcom w ASD nigdy nie było związane z innymi organizmami paciorkowcowymi niż GABHS. W reakcjach autoimmunologicznych związanych z GABHS w PANDAS i ASD pośredniczą białka powierzchniowe specyficzne dla S. pyogenes, a nie przenoszone przez S. thermophilus. S. thermophilus jest stosowany jako probiotyczny składnik jogurtów i innych fermentowanych produktów mlecznych i wykazuje wiele korzyści zdrowotnych dla ludzi. Nie ma podstaw, aby sądzić, że S. thermophilus wywołuje reakcje autoimmunologiczne, podobnie jak GABHS, i raczej sugeruje się, że ten probiotyczny organizm może chronić przed wzrostem GABHS i innych potencjalnie szkodliwych gatunków paciorkowców u ludzi.